Przyczyniło się to powstania czarnej legendy Bony, według której królowa była ,,dobra" tylko z imienia, a w istocie chorobliwie ambitna, zachłanna, skłonna do makiawelicznych machinacji oraz, jak na renesansową Włoszkę przystało, do trucicielstwa. Pomawiano ją otrucie dwóch pierwszych synowych (Elżbiety Habsburżanki i Barbary Radziwiłłówny) oraz dwóch ostatnich piastowskich książąt Mazowsza (Stanisława i Jana III), które dzięki temu zostało szybko anektowane przez Polskę. Na Mazowszu zresztą skłócona z synem Bona sama zamieszkała na osiem lat, po czy wróciła do Włoch. Tam polska królowa wdowa sama została otruta, prawdopodobnie na zlecenie Habsburgów, którzy winni jej byli zbyt dużo pieniędzy, bo mogli zostawić ją przy życiu.
[[File:Ogrody wawelskie.jpg|thumb|Zrekonstruowany na Wawelu skrzyniowy ogród ziołowy z czasów królowej Bony]]
<gallery mode=packed>
File:Fragment fryzu z Sali Poselskiej na Wawelu.jpg
File:Bona SGOgrody wawelskie.jpg|Zrekonstruowany na Wawelu skrzyniowy ogród ziołowy z czasów królowej Bony
</gallery>